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    染性疾病常常讓我們渾身不自在，近日，刊登在國際雜志PLoS ONE上的一篇研究論文中，來自布萊根婦女醫院的研究人員利用特殊的計算機模型揭示了機體感染影響腸道天然菌群的分子機制，相關研究或可幫助臨床醫生們開發治療胃腸道感染及炎癥的新型療法。

    研究者Lynn Bry表示，我們腸道中的細菌數量是機體細胞的10倍以上，而面臨感染時，這些復雜菌群的生態系統的表現會大大影響我們機體的健康。文章中研究者開發了一種新型計算機算法，它可以對檸檬酸桿菌引發的感染的不同階段進行分析，檸檬酸桿菌可以引發小鼠患病，類似于人類食物中毒的表現。
研究者將檸檬酸桿菌引入小鼠腸道中，兩個月后就可以在小鼠腸道中的多個位點發現不同水平的檸檬酸桿菌，這種新型計算機算法可以幫助研究人員在和感染、炎癥相關的腸道復雜菌群中鑒別出細菌的動力學改變。
    采用一種傳染性結腸炎小鼠模型與病原體枸櫞酸rodentium，研究者們2個月的時間產生了序列16S rDNA基因譜，并定量培養的共生，在感染和未感染的小鼠小腸多站點。研究者發現個別類群的時變特征的計算框架，并自動簽名鑒定微生物的子社區內較大的腸道生態系統，證明了普通的行為。
    當小鼠處于感染期間時，研究者在小鼠腸道的不同位置發現了正常菌群的許多破壞情況，比如，研究人員發現小鼠結腸組織中的細菌標記在小鼠感染細菌后出現癥狀之前的水平不斷下降，而其它的標記包括梭菌和乳桿菌家族的水平出現了上升的趨勢；更有意思的是，這些標記中的一部分會在腸道感染病原體的位點中發生，其并不會直接損傷宿主的細胞。
    研究者Bry表示，從臨床角度來講，我們鑒別出的這些新型微生物標記可以幫助臨床醫生們檢測機體的早期炎癥或者胃腸道疾病患者持久耐藥性疾病，比如炎性腸病；而研究者鑒別出的許多時間依賴性的微生物標記或許可以幫助科學家們開發出治療感染和炎性疾病的新型靶向療法。