普通感冒大部分是由病毒引起的，鼻病毒是引起普通感冒最常見的病原體，其他病毒包括冠狀病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒等。翻看國內外指南，目前并沒有針對感冒治療的抗病毒特效藥，藥物治療以對癥治療、緩解感冒癥狀為主。
由中國醫師協會呼吸醫師分會和急診醫師分會共同起草的《2012 普通感冒診治指南》中明確提出，不建議用抗菌藥物治療普通感冒，且抗菌藥物預防細菌感染是無效的。普通感冒無需使用抗病毒藥物治療。過度使用抗病毒藥物有明顯增加相關不良反應的風險。
雖然指南里說了，普通感冒不建議使用抗生素，這不代表感冒不能用抗菌藥，病毒引起的感冒隨病情發展可繼發為細菌感染。
《抗菌藥物臨床應用指導原則》中指出，“癥狀持續 7-10 天無改善或反而加重，或伴發熱、白細胞增高、C 反應蛋白增高等，考慮細菌感染，在積極尋找感染部位的同時，加用抗生素。”
在上呼吸道感染中，不同的感染部位的病原學有同有異，而這樣的病原學差異可是幫助我們來合理的判斷如果確診是細菌感染時候到底該如何使用抗生素。如下表：
中耳炎
常見：肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌、卡他布蘭漢球菌
少見：葡萄球菌、大腸桿菌、厭氧菌
偶見：病毒、支原體
咽炎，扁桃體炎
主要： A組溶血性鏈球菌
少數： C和G組鏈球菌
偶可：白喉棒狀桿菌、溶血不動桿菌、肺炎支原體，流感嗜血桿菌，肺炎鏈球菌、葡萄球菌
鼻-鼻竇炎
常見：肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌、卡他莫拉菌
少見：厭氧菌、金葡菌、化膿性鏈球菌及其他革蘭陰性桿菌
可見，在上呼吸道感染中出現的頻率最高的細菌有三種：“肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌、卡他莫拉菌”。
而這三種細菌基本都在青霉素和頭孢類抗生素中幾種比較常用的、且不是太“高級”，價格也比較適中的、老百姓喜聞樂見的，所謂“消炎藥”的抗菌譜中！
比如青霉素類的：青霉素 G、青霉素 V 鉀、氨芐西林、阿莫西林等。
比如頭孢類的：頭孢氨芐（先鋒 4 號），頭孢唑啉（頭孢 5 號）、頭孢羥氨芐、頭孢替唑、頭孢呋辛等。
比如大環內酯類：紅霉素、羅紅霉素、阿齊霉素等。
在這里我們特別來說說大家常說的頭孢類藥物。
目前常用的頭孢分為 4 大代，這里我們必須要樹立的一種觀念是，并不是代數越高的頭孢就是越好的，或者越高級的抗生素。頭孢類藥物的分代主要依據是其抵抗細菌的抗菌譜變化而言。
在一般情況下，普通感冒并不需要用到 3 代及以上的頭孢，這樣容易造成耐藥菌的產生。
如果對頭孢或者青霉素過敏的人可以考慮使用大環內酯類抗生素，但是對于大環內酯類抗生素存在一個問題，即對紅霉素耐藥的，對羅紅霉素和阿齊霉素不見得耐藥；但是對后兩者耐藥的人基本都對紅霉素耐藥。這個就提示我們在使用大環內酯類抗生素時，最好從簡單而便宜的紅霉素用起。
而針對上呼吸道感染不同部位的抗生素的選擇則科參考《抗菌藥物臨床應用指導原則》。
1. 急性細菌性咽炎及扁桃體炎
【治療原則】
針對β溶血性鏈球菌感染選用抗菌藥物。
給藥前先留取咽拭培養，有條件者可做快速抗原檢測試驗 (RADT) 作為輔助病原診斷。
由于溶血性鏈球菌感染后可發生非化膿性并發癥——風濕熱和腎小球腎炎，因此抗菌治療以清除病灶中細菌為目的，療程需 10 天。
【病原治療】
青霉素為首選，可選用青霉素 G，也可肌注普魯卡因青霉素或口服青霉素 V，或口服阿莫西林，療程均為 10 天。某些患者的依從性較差，預計難以完成 10 天療程者，可予芐星青霉素單劑肌注。
青霉素過敏患者可口服紅霉素等大環內酯類，療程 10 天。
其他可選藥有口服第一代或第二代頭孢菌素，療程 10 天，但不能用于有青霉素過敏性休克史的患者。此外，磺胺類藥不易清除咽部細菌，A 組溶血性鏈球菌對四環素類耐藥者多見，這兩類藥物均不宜選用。
2. 急性細菌性中耳炎
【治療原則】
抗菌治療應覆蓋肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌和卡他莫拉菌。
療程 7～10 天，以減少復發。
中耳有滲液時需采取標本做細菌培養及藥敏試驗。
【病原治療】
初治宜口服阿莫西林。如當地流感嗜血桿菌、卡他莫拉菌產β內酰胺酶菌株多見時，也可選用阿莫西林 / 克拉維酸口服。
其他可選藥物有復方磺胺甲噁唑和第一代、第二代口服頭孢菌素。
青霉素過敏患者除有青霉素過敏性休克史者外，確有用藥指征時可慎用頭孢菌素類。
3. 急性細菌性鼻竇炎
【治療原則】
初始治療宜選用能覆蓋肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌和卡他莫拉菌的抗菌藥物。在獲知細菌培養及藥敏試驗結果后，必要時再加以調整。
局部用血管收縮藥，以利于鼻竇內膿液引流。
療程 10～14 天，以減少復發。
【病原治療】
抗菌藥物的選用與急性細菌性中耳炎相同。
